薬を飲み忘れたら、２回分一緒に飲んでイイですか？また、水以外で飲んでもイイですか？

飲み忘れても２回分はまとめて飲んではいけません。
それから、お薬はコップ一杯の水、又は、白湯で飲んでください。吸収が悪くなるものや、逆に吸収が良くなり効果や副作用が強く出るなど、相互作用のある飲み物があります。

どこの薬局でも処方せんを持っていけば、薬は調剤してもらえますか？

医薬品の種類は何万とあります。どんな薬局でもすべての薬を備蓄しているわけではありません。備蓄していない薬剤の処方がでるとすぐには対応できないので、あらかじめ連絡をとった方がよいでしょう。